Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SHROOM2Q13796 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHROOM2Q13796 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHROOM2Q13796 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
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