Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTCH1Q13635 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTCH1Q13635 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTCH1Q13635 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
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