Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDH18Q13634 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH18Q13634 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH18Q13634 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
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