Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HSPB3Q12988 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HSPB3Q12988 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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