Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CREMQ03060 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CREMQ03060 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CREMQ03060 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREMQ03060 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREMQ03060 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREMQ03060 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREMQ03060 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREMQ03060 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREMQ03060 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREMQ03060 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREMQ03060 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CREMQ03060 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREMQ03060 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREMQ03060 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREMQ03060 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREMQ03060 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREMQ03060 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREMQ03060 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms