Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUNX1Q01196 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX1Q01196 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms