Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A1P54219 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18A1P54219 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms