Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC11A2P49281 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A2P49281 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms