Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC1A2P43004 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A2P43004 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms