Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ITGAEP38570 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ITGAEP38570 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGAEP38570 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGAEP38570 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGAEP38570 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ITGAEP38570 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.81■■■■□ 3
ITGAEP38570 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
ITGAEP38570 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ITGAEP38570 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITGAEP38570 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGAEP38570 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms