Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	FZO1	YBR179C	2568 nt		4.18	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	IXR1	YKL032C	1794 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	STR2	YJR130C	1920 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	TIP20	YGL145W	2106 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	snR3	snR3	194 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.17	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	FDC1	YDR539W	1512 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	MTR10	YOR160W	2919 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	FMP48	YGR052W	1110 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	GRE1	YPL223C	507 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	SRB6	YBR253W	366 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.16	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	GRC3	YLL035W	1899 nt		4.15	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	MST1	YKL194C	1389 nt		4.15	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.15	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	DIT1	YDR403W	1611 nt		4.15	□□□□□ -1.74
ATG12	P38316	CWC2	YDL209C	1020 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	CPR1	YDR155C	489 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	CNN1	YFR046C	1086 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	PRE9	YGR135W	777 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	PER33	YLR064W	822 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	RSA3	YLR221C	663 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	AIP1	YMR092C	1848 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	ARH1	YDR376W	1482 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SSH1	YBR283C	1473 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YDL109C	YDL109C	1944 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	TPA1	YER049W	1935 nt		4.15	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	FKH2	YNL068C	2589 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	CDC48	YDL126C	2508 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	VPS73	YGL104C	1461 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YCR085W	YCR085W	354 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SNM1	YDR478W	597 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YGR011W	YGR011W	327 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YHR032C-A	YHR032C-A	120 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	RPL14A	YKL006W	417 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	EOS1	YNL080C	1101 nt		4.14	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	KIN4	YOR233W	2403 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	PHO84	YML123C	1764 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	RCR2	YDR003W	633 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	LSB1	YGR136W	726 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	RSF1	YMR030W	1131 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	PRM7	YDL039C	2097 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YOL075C	YOL075C	3885 nt		4.13	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	AIM21	YIR003W	2040 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	GAL4	YPL248C	2646 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	LDB17	YDL146W	1476 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	ECM32	YER176W	3366 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	AHA1	YDR214W	1053 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	CNL1	YDR357C	369 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SPC42	YKL042W	1092 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SEC2	YNL272C	2280 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	DXO1	YDR370C	1329 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	ATG26	YLR189C	3597 nt		4.12	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	MAD3	YJL013C	1548 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	LEU1	YGL009C	2340 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YER134C	YER134C	537 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	MRPL25	YGR076C	474 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	MAD2	YJL030W	591 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	RPS19A	YOL121C	435 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SSL1	YLR005W	1386 nt		4.11	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SEO1	YAL067C	1782 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	PTA1	YAL043C	2358 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YPL014W	YPL014W	1146 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YPL162C	YPL162C	822 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	EFM2	YBR271W	1260 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.1	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	UIP3	YAR027W	708 nt		4.09	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	SLX1	YBR228W	915 nt		4.09	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	YDR132C	YDR132C	1488 nt		4.09	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.09	□□□□□ -1.75
ATG12	P38316	LOS1	YKL205W	3303 nt		4.09	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SIR2	YDL042C	1689 nt		4.09	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	SKG6	YHR149C	2205 nt		4.09	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	HSP30	YCR021C	999 nt		4.08	□□□□□ -1.76
ATG12	P38316	ELO2	YCR034W	1044 nt		4.08	□□□□□ -1.76

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