Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SSFA2P28290 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SSFA2P28290 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms