Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO2P25791 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO2P25791 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO2P25791 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO2P25791 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO2P25791 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO2P25791 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMO2P25791 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMO2P25791 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMO2P25791 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO2P25791 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO2P25791 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO2P25791 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms