Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LYL1P12980 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LYL1P12980 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYL1P12980 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYL1P12980 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LYL1P12980 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYL1P12980 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms