Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IGKV1-13P0DP09 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGKV1-13P0DP09 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms