Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MBD4O95243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MBD4O95243 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MBD4O95243 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MBD4O95243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MBD4O95243 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MBD4O95243 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MBD4O95243 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MBD4O95243 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MBD4O95243 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MBD4O95243 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MBD4O95243 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MBD4O95243 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms