Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL2O95198 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL2O95198 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms