Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF3O75054 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF3O75054 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF3O75054 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms