Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE8AO60658 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE8AO60658 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE8AO60658 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms