Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SPAG9O60271 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SPAG9O60271 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SPAG9O60271 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SPAG9O60271 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SPAG9O60271 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SPAG9O60271 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPAG9O60271 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms