Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB2O43679 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB2O43679 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB2O43679 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB2O43679 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB2O43679 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB2O43679 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB2O43679 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB2O43679 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB2O43679 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB2O43679 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB2O43679 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB2O43679 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB2O43679 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB2O43679 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDB2O43679 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms