Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ3A6PVS8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRIQ3A6PVS8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms