Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GVL5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GVL5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms