Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF12Q9Y4X4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KLF12Q9Y4X4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms