Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NOP58Q9Y2X3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NOP58Q9Y2X3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms