Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
COG6Q9Y2V7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG6Q9Y2V7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG6Q9Y2V7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms