Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOX13Q9UN79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOX13Q9UN79 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SOX13Q9UN79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms