Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BRPF3Q9ULD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
BRPF3Q9ULD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRPF3Q9ULD4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms