Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDP2Q9P2J9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDP2Q9P2J9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDP2Q9P2J9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms