Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PRO2289Q9P1D8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms