Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD3Q9NX63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD3Q9NX63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms