Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO8Q9NRD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FBXO8Q9NRD0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FBXO8Q9NRD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms