Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPS4Q9NQG7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPS4Q9NQG7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HPS4Q9NQG7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms