Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO1B3Q9NPD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms