Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW5

WDR6, WD repeat-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6Q9NNW5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR6Q9NNW5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR6Q9NNW5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms