Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNHG12Q9BXW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNHG12Q9BXW3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms