Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BBS2Q9BXC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BBS2Q9BXC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms