Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD9AQ99638 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9AQ99638 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9AQ99638 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.2 ms