Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUDCD1Q96RS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NUDCD1Q96RS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms