Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLMNQ96JQ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLMNQ96JQ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms