Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX27Q96GQ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX27Q96GQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms