Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RB1CC1Q8TDY2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RB1CC1Q8TDY2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RB1CC1Q8TDY2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC43.69■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RB1CC1Q8TDY2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms