Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LINC00116Q8NCU8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms