Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeastyeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HUB1Q6Q546 YER034WYER034W 558 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 AIM22YJL046W 1230 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 COA3YJL062W-A 258 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 ADD37YMR184W 597 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 YPL199CYPL199C 723 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 GAS4YOL132W 1416 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 YLR352WYLR352W 2424 nt2.48□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 TAF8YML114C 1533 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 RDH54YBR073W 2877 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 OSH2YDL019C 3852 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 KRI1YNL308C 1776 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 JEM1YJL073W 1938 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 DPB2YPR175W 2070 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 MTC4YBR255W 2085 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 NOP16YER002W 696 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 VFA1YER128W 612 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 SPI1YER150W 447 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 PRE3YJL001W 648 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 MRP8YKL142W 660 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 LDS2YOL047C 1071 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 YOR111WYOR111W 699 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 FLO9YAL063C 3969 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 APN2YBL019W 1563 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 ADP1YCR011C 3150 nt2.47□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 YSP2YDR326C 4317 nt2.46□□□□□ -2.01
HUB1Q6Q546 ELM1YKL048C 1923 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 BAR1YIL015W 1764 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 NCR1YPL006W 3513 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SPT3YDR392W 1014 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 ECO1YFR027W 846 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 VPS29YHR012W 849 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 EGD2YHR193C 525 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 AIM20YIL158W 615 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 TVP18YMR071C 504 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SUI1YNL244C 327 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 UBP7YIL156W 3216 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 GAC1YOR178C 2382 nt2.46□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YER077CYER077C 2067 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 AAD3YCR107W 1092 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 GIR2YDR152W 798 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YGL074CYGL074C 327 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YGR066CYGR066C 879 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MRP4YHL004W 1185 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SAE3YHR079C-A 276 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 LOH1YJL038C 660 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SPO7YAL009W 780 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 URA1YKL216W 945 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SNF8YPL002C 702 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MFM1YPL060W 1242 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 RTS1YOR014W 2274 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SKM1YOL113W 1968 nt2.45□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 UBP6YFR010W 1500 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 NGL3YML118W 1518 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 BUD7YOR299W 2241 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MRPL11YDL202W 750 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SEC53YFL045C 765 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 FHN1YGR131W 525 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 ERG3YLR056W 1098 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 IMD1YAR073W 1212 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YPL088WYPL088W 1029 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YPL168WYPL168W 1293 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 OAF1YAL051W 3144 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MST1YKL194C 1389 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 BYE1YKL005C 1785 nt2.44□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MET3YJR010W 1536 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MCD4YKL165C 2760 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 ALA1YOR335C 2877 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 HSP30YCR021C 999 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 FCF1YDR339C 570 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 USE1YGL098W 738 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 PUS6YGR169C 1215 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YJR037WYJR037W 384 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 NTR2YKR022C 969 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YAR070CYAR070C 300 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YML018CYML018C 1182 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 ARG4YHR018C 1392 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 BUD4YJR092W 4344 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 SUC2YIL162W 1599 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 KRE5YOR336W 4098 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 MNN4YKL201C 3537 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 OSH3YHR073W 2991 nt2.43□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 YBR139WYBR139W 1527 nt2.42□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 REB1YBR049C 2433 nt2.42□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 PMT6YGR199W 2280 nt2.42□□□□□ -2.02
HUB1Q6Q546 CBF5YLR175W 1452 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 228.7 ms