Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC23A3Q6PIS1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC23A3Q6PIS1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms