Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHLDB3Q6NSJ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHLDB3Q6NSJ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms