Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL39P5Q59GN2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPL39P5Q59GN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms