Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9B1Q4ZJI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9B1Q4ZJI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms