Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPEL1Q2QD12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPEL1Q2QD12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms