Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME3Q16798 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME3Q16798 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME3Q16798 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME3Q16798 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ME3Q16798 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME3Q16798 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME3Q16798 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME3Q16798 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ME3Q16798 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME3Q16798 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME3Q16798 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME3Q16798 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME3Q16798 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME3Q16798 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME3Q16798 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME3Q16798 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
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